یک دانشجوی جوان معتقد است که روح یک بیگانه از سیاره‌ای دیگر در زمان به عقب بازگشته و بدن او را تسخیر کرده است تا در میان بشریت نفوذ کرده و مطالعه کند تا دلایل نابودی تمدن ما در آینده را بیابد. او روح بیگانه دیگری را در دختری که ملاقات می‌کند بازسازی می‌کند و آن‌ها با هم از دوربین‌های ویدئویی خود برای مستندسازی جامعه شهری مدرن ژاپن استفاده می‌کنند.

«دایسوکه کاواشیما» ۱۵ ساله که از مدرسه خسته شده است، سفری را برای بازدید از درخت سدر ۷۰۰۰ ساله در جزیره دورافتاده یاکوشیما آغاز می‌کند. دایسوکه در طول سفر خود با افراد جالب متعددی ملاقات می‌کند، از جمله یک راننده کامیون صمیمی به نام سومیره و یک دختر کوهنورد مرموز.

داستان انیمیشن Tokyo Godfathers پدر خوانده های توکیو در یک شب کریسمس در شهر توکیو آغاز می شود که سه نفر بی خانمان به نام های جین و هانا که مرد و زنی میانسال هستند و دختری به نام میوکی که با آنها زندگی می کند ، وقتی به دنبال غذا می گشتند به یک نوزاد رها شده بر می خورند ، به همراه این نوزاد یه نامه بود که از یابنده نوزاد خواسته تا از او مراقبت کند ولی از نام نوزاد چیزی نگفته و یک کیسه که حاوی سره نخ هایی از پدر و مادر اصلی این نوزاد می باشد ، آغاز می شود . این سه نفر تصمیم می گیرند تا تمام تلاش خود را برای پیدا کردن والدین اصلی این نوزاد بکار گیرند و او را به خانواده واقعیش برسانند . چون او را در شب کریسمس پیدا کردند نام این نوزاد را Kiyoko به معنای فرزند خالص می گذارند . پدر خوانده های توکیو یک انیمیشن ساخت ژاپن به کارگردانی Satoshi Kon و Shōgo Furuya می باشد که در سال ۲۰۰۳ ساخته شد . Tokyo Godfathers سومین انیمیشنی است که Kon نوشته و کارگردانی کرده است . وی فیلنامه این انیمیشن را با همکاری Keiko Nobumoto نوشت و در سال ۲۰۰۳ این انیمیشن موفق به دریافت جایزه جشنواره هنر ژاپن گردید